Jmol
Jmol — программа для просмотра структуры молекул в трёх измерениях.
| Jmol | |
|---|---|
mol_logo_2013.svg.png.webp){kind=logo} | |
 Jmol — Java программа для визуализации трёхмерных молекулярных структур | |
| Тип | Биоинформатика |
| Автор | Дэн Гезельтер[d][1] |
| Разработчик | Команда разработчиков Jmol |
| Написана на | Java |
| Операционная система | Кроссплатформенный |
| Языки интерфейса | каталанский, китайский, чешский, немецкий, английский, французский, нидерландский, венгерский, итальянский, корейский, португальский, испанский, турецкий, русский |
| Аппаратная платформа | Java Virtual Machine |
| Последняя версия | 14.31.18 (19 ноября 2020) |
| Читаемые форматы файлов | Protein Data Bank, CIF, MDL Molfile[d], CML, SMILES и XYZ file format[d] |
| Лицензия | LGPL |
| Сайт | jmol.org |
 Медиафайлы на Викискладе | |
Jmol используется как для учебных целей[2], так и при проведении научных исследований в области молекулярной биологии, химии и биохимии. Программа является свободной и открытой. Она написана на языке Java и потому является кроссплатформенной. Существует как отдельная программа, так и средства для интеграции в другое Java-приложение. Чаще всего программа используется как аплет, встраиваемый в веб-страницу. Программа позволяет строить изображения молекул несколькими способами. Jmol поддерживает большое количество форматов файлов, включая:
- Protein Data Bank (pdb)
- Crystallographic Information File (cif)
- MDL Molfile (mol)
- Chemical Markup Language (CML)
- Chemical File Format (XYZ).
Скриншоты
Кристаллическая структура H/ACA коробки RNP из архебактерии Pyrococcus furiosus.
Подсвечивание двух солевых мостиков в тетрамере гемоглобина (гемо-группа изображена палочками в нижнем правом углу).
Фрагмент транскрипционного фактора TFIIIA, образующего три последовательных цинковых пальца, присоединённых к последовательности ДНК.
Ссылки
Примечания
- Hanson R. M., Hanson R. M. Web-Based Molecular Visualization for Chemistry Education in the 21st Century — 2010. — С. 65—77. — doi:10.1021/BK-2010-1060.CH004
- A. Herraez. Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue (англ.) // Biochemistry and Molecular Biology Education. — 2006. — Vol. 34, no. 4. — P. 7.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.